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Identification of a 301 bp promoter core region of the SrUGT91D2 gene from Stevia rebaudiana that contributes to hormone and abiotic stress inducibility

作者
Jinsong Chen, Renlang Liu, Chengcheng Lyv, Mengyang Wu, Siqin Liu, Meiyan Jiang, Yurou Zhang, Dongbei Xu, Kai Hou, Wei Wu
单位
College of Agronomy, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China
杂志
BMC Plant Biology(2024)
DOI
10.1186/s12870-024-05616-1
所属领域
代谢工程
关键词
Exogenous hormonesGUSLightPromoterSrUGT91D2Stevia rebaudiana Bertoni
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解决的核心问题

解析甜菊糖苷合成关键基因 SrUGT91D2 的启动子功能,鉴定其核心调控区域及响应激素与非生物胁迫的顺式作用元件。

研究策略

从六个甜菊品系克隆 SrUGT91D2 启动子,进行序列比对和顺式元件预测;构建全长及系列 5' 缺失和 3' 缺失片段与 GUS 报告基因融合的植物表达载体,通过农杆菌介导烟草叶片瞬时转化和 GUS 活性分析鉴定核心启动子区;进一步用 ABA、IAA 和光照处理评估其诱导响应。

研究路线图

100%
研究问题:解析SrUGT91D2启动子核心调控区域及响应元件
策略:克隆6个品系启动子,序列比对+元件预测
关键改造:构建5'和3'系列缺失+GUS融合载体
结果1:6品系启动子长度1952-1989bp,发现26bp InDel
结果2:5'缺失分析定位-1983~-1633为关键区(GUS↓87.6%)
关键改造:P8片段(301bp)保留近全长活性
结果3:ABA/IAA/光照下P8-B1188活性↑17.79%/13.49%/7.51%
结果4:P8-023(无26bp InDel)无明显激素/光响应
结论:-1983~-1683为核心区,26bp InDel正调控激素/光响应
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核心内容

该研究从六个甜菊品系中克隆了甜菊糖苷合成关键基因SrUGT91D2的启动子序列,长度介于1952至1989 bp之间,并构建了全长及各系列5'端和3'端缺失片段与GUS报告基因融合的植物表达载体,通过农杆菌介导的烟草叶片瞬时转化进行功能解析。序列分析发现五个品系在-1738至-1713区间存在一个26 bp的插入/缺失片段,而品系023缺失该片段。5'缺失实验表明,缺失-1983至-1633区域使GUS活性下降87.60%,而包含-1983至-1683的301 bp片段(P8)保留了接近全长启动子的活性。在100 μM ABA、100 μM IAA及光照处理下,含该26 bp片段的P8-pSrUGT91D2-B1188启动子GUS活性分别比对照提高17.79%、13.49%和7.51%,而缺失该片段的P8-pSrUGT91D2-023无明显响应。研究首次鉴定了SrUGT91D2启动子远端-1983至-1683区域为核心功能区,其中26 bp InDel是响应ABA、IAA和光信号的正调控关键序列,为甜菊分子育种和基因表达调控研究提供了重要基础。

创新点

首次克隆并功能分析 SrUGT91D2 基因启动子;发现一个 26 bp 的插入/缺失片段(位于 -1738~-1713)是影响启动子转录活性的关键序列,并揭示其在 ABA、IAA 和光诱导中的正调控作用;鉴定出一个位于远端的功能性核心启动子区域(301 bp)。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Stevia rebaudiana 甜菊糖苷(steviol glycosides)生物合成 SrUGT91D2 UDP-糖基转移酶 SrUGT91D2 催化 催化C19和C13位1,2-β-D-葡萄糖苷键的形成,参与Reb D和Reb M的合成
Nicotiana benthamiana 报告基因瞬时表达系统 GUS β-葡萄糖醛酸酶(GUS) 催化 用作启动子活性分析的报告基因
Stevia rebaudiana 甜菊糖苷生物合成 pSrUGT91D2 调控 SrUGT91D2基因启动子,包含TATA/CAAT框及响应激素、光和胁迫的顺式元件
Nicotiana benthamiana 启动子功能分析 P8片段 调控 核心启动子区域(-1983~-1683,301 bp),含26 bp InDel,响应ABA、IAA和光诱导

关键发现

  1. 从六个品系克隆的 pSrUGT91D2 长度分别为
  2. 1989、1984、1983、1982、1985 bp;五个品系(110、1114、B1188、GP、GX)存在一个 26 bp InDel(-1738~-1713),而品系 023 缺失该片段。启动子活性顺序为 pSrUGT91D2-B1188 > pSrUGT91D2-GP > pSrUGT91D2-1114 > pSrUGT91D2-110 > pSrUGT91D2-GX > pSrUGT91D2-023。5' 缺失分析表明,缺失 -1983~-1633 区域导致 GUS 活性下降
  3. 60%,而 P8 片段(-1983~-1683,301 bp)保留接近全长启动子的活性。在 ABA(100 μM)、IAA(100 μM)和光照处理下,P8-pSrUGT91D2-B1188 的 GUS 活性分别比未处理对照提高
  4. 79%、13.49% 和
  5. 51%,而 P8-pSrUGT91D2-023 无明显响应。

研究结论

SrUGT91D2 启动子核心功能区位于 -1983~-1683(301 bp)区域,其中 26 bp InDel(-1738~-1713)是响应 ABA、IAA 和光的关键序列,正调控基因表达;该研究加深了对 SrUGT91D2 表达调控机制的理解,为甜菊分子育种提供理论依据。