Screening of lactic acid bacteria for their potential as microbial cell factories for bioconversion of lignocellulosic feedstocks
- 作者
- Anna Monika Boguta, Françoise Bringel, Jan Martinussen, Peter Ruhdal Jensen
- 单位
- Division of Industrial Food Research, National Food Institute, Systems Biotechnology & Biorefining, Technical University of Denmark; Departement Genetique Moleculaire, Universite de Strasbourg, UMR7156 CNRS; Department of Systems Biology, Intracellular Signaling and Regulation Group, Technical University of Denmark
- 杂志
- Microbial Cell Factories(2014)
- DOI
- 10.1186/s12934-014-0097-0
- 所属领域
- 代谢工程
- 关键词
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解决的核心问题
缺乏能够高效利用木质纤维素生物质(尤其是C5糖)并耐受预处理过程中产生的抑制剂的微生物底盘菌株。
研究策略
系统筛选296株乳酸菌和片球菌,通过固体和液体培养评估其生长、戊糖利用能力以及对常见抑制剂的耐受性,并利用组合抑制剂模拟不同木质纤维素水解液条件,选出最优菌株。
核心内容
该研究系统筛选了296株乳酸菌与片球菌,旨在寻找能高效利用木质纤维素中的C5糖并耐受预处理抑制剂的微生物底盘。通过固体和液体培养评估菌株生长、戊糖利用能力及对糠醛、HMF、香兰素等抑制剂的耐受性,并用组合抑制剂模拟甘蔗渣、麦秆和软木水解液条件进行验证。结果鉴定出3株戊糖乳杆菌、1株酸酒片球菌和1株戊糖片球菌兼具木糖、阿拉伯糖利用能力和高抑制剂耐受性;其中最佳戊糖乳杆菌在3.5 g/L糠醛下生长速率下降不超过32%,酸酒片球菌在木糖上生长速率仅比葡萄糖低14%。在模拟甘蔗渣、麦秆和软木条件下,所选菌株生长速率分别仅下降4%、1%和37%,而大肠杆菌MG1655分别下降36%、21%和90%。这些候选菌株的综合表现优于大肠杆菌,具备作为第二代生物转化平台菌株的潜力,可作为进一步代谢工程改造的起点。
创新点
首次对乳酸菌属和片球菌属进行大规模系统性筛选,将C5糖利用能力与抑制剂耐受性相结合,鉴定出可耐受高浓度糠醛、HMF、香兰素等抑制剂且能利用木糖和阿拉伯糖的候选菌株,其综合表现优于大肠杆菌。
研究对象(4)
| 底盘细胞 | 代谢通路 | 基因 | 蛋白 | 功能 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|
| Lactobacillus pentosus (LMG 17672, LMG 17673, 10-16) | 木质纤维素生物转化 | — | — | — | 能同时利用木糖和阿拉伯糖,对糠醛、HMF、香兰素等抑制剂耐受,在模拟甘蔗渣、麦秆和软木条件下生长速率下降仅4%、1%和37%(相对于对照) |
| Pediococcus acidilactici DSM 20284 | 木质纤维素生物转化 | — | — | — | 能利用C5糖,木糖上生长速率比葡萄糖低14%,阿拉伯糖上相似,对组合抑制剂耐受性良好 |
| Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 | 木质纤维素生物转化 | — | — | — | 能利用C5糖,木糖上生长速率比葡萄糖低48%,阿拉伯糖上相似,对组合抑制剂耐受性良好 |
| Escherichia coli MG1655 | 木质纤维素生物转化 | — | — | — | 作为对照菌株,在相同抑制剂组合条件下生长速率下降36%、21%和90%,明显差于筛选出的乳酸菌 |
关键发现
- 296株菌中3株L. pentosus、1株P. acidilactici和1株P. pentosaceus既能利用木糖和阿拉伯糖又对关键抑制剂高度耐受
- 在模拟甘蔗渣、麦秆和软木的抑制剂组合条件下,所选菌株生长速率分别仅下降4%、1%和37%,而E. coli MG1655分别下降36%、21%和90%
- 液体培养中最佳L. pentosus菌株在3.5 g/L糠醛下生长速率下降不超过32%,在20 g/L糠醇下下降24%–46%,在0.43 g/L香兰素下生长相似或更好
- P. acidilactici DSM 20284和P. pentosaceus ATCC 25745在木糖上的生长速率比葡萄糖低14%和48%,在阿拉伯糖上生长速率与葡萄糖相当
- 256株能在3.5 g/L糠醛上生长,141株能在5.9 g/L HMF上生长
- 16株最佳菌株中11株能在1.72 g/L香兰素上生长。
研究结论
部分L. pentosus、P. acidilactici和P. pentosaceus菌株具备成为第二代生物转化平台菌株的潜力,它们能耐受木质纤维素预处理产生的关键抑制剂并利用C5糖,可作为进一步代谢工程改造的起点。