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Metabolic engineering of terpene metabolism in lavender

作者
Ojo Michael Oseni, Reza Sajaditabar, Soheil S. Mahmoud
杂志
Journal of Genetic Engineering and Biotechnology(2024)
DOI
10.1186/s43088-024-00524-7
所属领域
代谢工程
关键词
IsoprenoidsLavenderMetabolic engineeringMonoterpenesTerpene synthase
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解决的核心问题

如何通过代谢工程提高薰衣草精油(主要含单萜)的产量和品质,并在微生物中异源合成薰衣草单萜成分。

研究策略

系统综述薰衣草单萜生物合成基因的克隆与功能表征,以及通过植物和微生物代谢工程(如过表达MEP/MVA途径基因、引入萜类合酶、蛋白融合、支架、区室化等策略)提高单萜产量的研究进展。

研究路线图

100%
研究问题:
如何通过代谢工程提高薰衣草单萜产量与品质
策略:
系统综述单萜生物合成基因克隆与代谢工程
结果 (酵母):
LINS-ERG20融合使芳樟醇产量提高69.7%,双途径达7.61mg/L
关键改造 (植物):
腺毛特异启动子表达、DXS过表达、LiBPPS调控
关键改造 (微生物):
过表达MVA途径、蛋白融合、支架、区室化
结论:
单萜合酶基因已在多宿主成功表达,但组成型过表达有害,需利用腺毛特异性启动子精准表达
结果 (大肠杆菌):
芳樟醇最高达1027.3mg/L,1,8-桉叶素达505mg/L,支架策略提升产量
结果 (蓝藻/其他真菌):
S-芳樟醇11.6mg/L,红冬孢酵母中1,8-桉叶素显著提高
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核心内容

该综述系统梳理了薰衣草单萜生物合成基因的克隆与功能表征,并重点总结了在微生物和植物中通过代谢工程提升单萜产量的策略。在微生物宿主方面,研究者将薰衣草萜类合酶异源表达于大肠杆菌、酵母和蓝藻,采用蛋白融合、支架、区室化、前体供给强化等手段。例如,LINS与ERG20融合蛋白使酵母芳樟醇产量较游离酶提高69.7%;在大肠杆菌中,通过改造bLIS、增强GPP供给和补料分批发酵,芳樟醇产量最高达1027.3 mg/L;1,8-桉叶素通过双质粒系统和优化从228 mg/L提升至505 mg/L。蓝藻中表达密码子优化的LINS,S-芳樟醇产量为11.4 mg/L。在植物方面,过表达DXS可显著增加穗薰衣草精油,但组成型过表达萜类合酶常因非腺毛细胞无法耐受大量单萜而对植株有害。因此,未来应利用腺毛特异启动子实现转基因组化表达,从而在提高精油产量与品质的同时,将薰衣草开发为生产高价值植物化学品的生物反应器。

创新点

综述了将薰衣草萜类合成酶异源表达于大肠杆菌、酵母和蓝藻的多种代谢工程策略,总结了不同策略对单萜产量的具体提升效果,并提出利用腺毛特异启动子实现特异表达以避免组成型过表达伤害植物的未来方向。

研究对象(31)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
E. coli 单萜生物合成(MEP途径下游) LaLIMS Limonene synthase 催化 重组LaLIMS产生柠檬烯、萜品油烯、莰烯、α-蒎烯、β-月桂烯和微量α-水芹烯
E. coli 单萜生物合成 LaLINS Linalool synthase 催化 专一产生(R)-(-)-芳樟醇
E. coli 倍半萜生物合成 LaBERS Bergamotene synthase 催化 将FPP转化为bergamotene
E. coli 单萜生物合成 LaβPHLS β-Phellandrene synthase 催化 以GPP和NPP为底物产生β-水芹烯
E. coli 单萜生物合成 LiCINS 1,8-Cineole synthase 催化 蛋白约63 kDa,转化GPP产生1,8-桉叶素
E. coli 单萜生物合成(不规则单萜) LiLPPS Lavandulyl diphosphate synthase 催化 约34.5 kDa,催化两分子DMAPP头-中缩合生成LPP
E. coli 单萜生物合成(龙脑/樟脑) LiBDH Borneol dehydrogenase 催化 转化龙脑为樟脑
E. coli 倍半萜生物合成 LiCPS Caryophyllene synthase 催化 转化FPP产生9-表石竹烯
E. coli 单萜生物合成(酯化) LiAAT-3/LiAAT-4 Alcohol acetyltransferase 催化 催化薰衣草醇乙酰化形成薰衣草乙酸酯
Lavandula pedunculata 单萜生物合成 LpFENS Fenchol synthase 催化 基因表达与产物积累一致
Lavandula pedunculata 单萜生物合成 LpPINS α-Pinene synthase 催化 基因表达与产物积累一致
Lavandula pedunculata 倍半萜生物合成 LpGEAS Germacrene A synthase 催化 基因表达与产物积累不一致
E. coli 单萜生物合成 Li3CARS 3-Carene synthase 催化 转化GPP主要产生3-蒈烯
E. coli 单萜生物合成 LiS-LINS S-Linalool synthase 催化 专一产生S-芳樟醇
E. coli / Nicotiana benthamiana 单萜/倍半萜生物合成 LaTPS7 Terpene synthase 7 催化 体外产生9种产物(包括莰烯、月桂烯、柠檬烯),烟草中产生柠檬烯
E. coli / Nicotiana benthamiana 单萜/倍半萜生物合成 LaTPS8 Terpene synthase 8 催化 以GPP和NPP产生8种挥发物,烟草中产生α-蒎烯和sylvestrene
Arabidopsis thaliana 花发育调控 LaSVP Short vegetative phase protein 调控 表达延迟开花,影响花器官产生萼片代替花瓣
Arabidopsis thaliana 花发育调控 LaAG-like AGAMOUS-like protein 调控 过表达促进早花
Arabidopsis thaliana 花发育调控 LaSEP3-like SEPALLATA3-like protein 调控 过表达促进早花,过量表达导致叶片卷曲
Arabidopsis thaliana / Nicotiana benthamiana 萜类生物合成调控 LaMYC4 MYC4 transcription factor 调控 过表达提高石竹烯等倍半萜含量
Lavandula latifolia MEP途径 DXS 1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase 催化 来自A. thaliana的DXS过表达显著提高精油产量
Saccharomyces cerevisiae MVA途径/单萜生物合成 ERG20 Farnesyl diphosphate synthase 催化 与LINS融合后效率提高69.7%,后续引入ERG20F96W-N127W突变增强
Saccharomyces cerevisiae MVA途径/单萜生物合成 LINS Linalool synthase 催化 来源包括Actinidia arguta、Mentha citrata、Cinnamomum osmophloeum
Saccharomyces cerevisiae MVA途径 MVA pathway genes Mevalonate pathway enzymes 催化 过表达完整MVA途径提高前体供给
Rhodotorula toruloides MEP途径/单萜生物合成 GPPS (Abies grandis), CINS (Hypoxylon sp.) Geranyl diphosphate synthase, 1,8-Cineole synthase 催化 N端截短GPPS与CINS共表达,显著提高1,8-桉叶素产量
Saccharomyces cerevisiae MVA途径/单萜生物合成 BPPS Bornyl diphosphate synthase 催化 来自Cinnamomum burmanni产生(+)-冰片,来自Blumea balsamifera经截短和Kozak优化增强生产
E. coli MVA途径/单萜生物合成 IPPS, GPPS, LINS IPP synthase, GPP synthase, Linalool synthase 催化 利用支架策略(1:1:4结构域重复)提高芳樟醇产量
E. coli MVA途径/单萜生物合成 bLIS Linalool synthase (from Streptomyces clavuligerus) 催化 通过RBS/TIR优化和融合标签提高溶解度,结合GPP供给和补料发酵最高达1027.3 mg/L
E. coli MVA途径/单萜生物合成 CINS 1,8-Cineole synthase (from Streptomyces clavuligerus) 催化 双质粒系统使1,8-桉叶素产量达505 mg/L
Synechocystis sp. PCC6803 单萜生物合成 LINS Linalool synthase (from Actinidia arguta) 催化 密码子优化后S-芳樟醇产量11.4 mg/L,共表达突变FPP合酶后11.6 mg/L
Synechococcus elongatus 单萜生物合成 CINS 1,8-Cineole synthase (from Streptomyces clavuligerus) 催化 IPTG诱导启动子控制,实现光合自养生产1,8-桉叶素

关键发现

  1. ['LINS与ERG20融合蛋白使酵母中的芳樟醇产量比游离酶提高69.7%。', '在酵母线粒体和细胞质双MVA途径中表达LINS(来自Cinnamomum osmophloeum)和ERG20F96W-N127W,芳樟醇产量达7.61 mg/L
  2. 添加70 mg/L mevalonolactone时产量最高。', '在大肠杆菌中构建异源MVA途径生产芳樟醇,初始产量15±1.4 mg/L,过表达IPP异构酶后增至63±5.6 mg/L
  3. 通过bLIS改造、GPP供给增强和补料分批发酵,最高达1027.3 mg/L。', '在大肠杆菌中表达1,8-桉叶素合酶,通过双质粒系统使产量从228 mg/L提高至305 mg/L,随后优化达到505 mg/L。', '在红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides)中利用N端截短的GPPS(来自Abies grandis)和CINS(来自Hypoxylon sp.)显著提高1,8-桉叶素产量。', '在蓝藻集胞藻PCC6803中表达密码子优化的LINS,S-芳樟醇产量为11.4 mg/L,共表达突变FPP合酶后达11.6 mg/L。', '在大肠杆菌中利用支架策略生产芳樟醇,1个IPPS、1个GPPS、4个LINS结构域的支架产量最高。', '过表达DXS的穗薰衣草(L. latifolia)转基因植株精油显著增加。', 'LiBPPS反义表达降低薰衣草中冰片和樟脑含量,正义表达提高含量但影响植物生长。', 'LaMYC4过表达提高了拟南芥和烟草中石竹烯等倍半萜含量。']

研究结论

大多数薰衣草精油单萜合酶基因已被克隆并功能表征,并已成功在细菌、酵母和模式植物中实现相应单萜的生产。然而,在薰衣草中组成型过表达萜类合酶基因常对植物有害,因为非腺毛细胞无法耐受大量单萜。未来利用腺毛特异启动子将转基因组化到腺毛中,可提高精油质量与产量,并使薰衣草成为生产高价值植物化学品的生物反应器。