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Protein engineering of Saccharomyces cerevisiae transporter Pdr5p identifies key residues that impact Fusarium mycotoxin export and resistance to inhibition

作者
Amanda B. Gunter, Anne Hermans, Whynn Bosnich, Douglas A. Johnson, Linda J. Harris, Steve Gleddie
单位
Ottawa Research and Development Centre, Agriculture and Agri-Food Canada; Ottawa-Carleton Institute of Biology, University of Ottawa
杂志
MicrobiologyOpen(2016)
DOI
10.1002/mbo3.381
所属领域
代谢工程
关键词
ABC transportersFusarium graminearumdeoxynivalenoldrug resistanceeninatinyeast
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解决的核心问题

鉴定并改造能够输出禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)产生的单端孢霉烯族毒素脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)及其乙酰化衍生物15A-DON的转运蛋白,以开发作物抗镰刀菌策略。

研究策略

利用酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)敲除菌株系统筛选PDR网络全部11个已知或推定的ABC转运蛋白,确认Pdr5p是主要输出者;随后对Pdr5p关键残基S1360和T1364进行定点饱和突变(各19种单氨基酸替换,共38个突变体),在Δpdr5菌株中表达,并测定其对DON/15A-DON的输出能力以及对FK506、enniatin B和F. avenaceum培养滤液的抗性。

研究路线图

研究问题:筛选能输出DON/15A-DON的转运蛋白
策略:敲除酵母PDR网络11个ABC转运蛋白基因
关键发现:确定Pdr5p是主要DON/15A-DON输出者
关键改造:对Pdr5p的S1360和T1364做38个定点突变
结果:多数突变体维持毒素输出,部分抵抗FK506/enniatin B
关键突变体:S1360D/E/K和T1364K在F. avenaceum滤液下保持高生长
结论:Pdr5p是毒素输出关键,突变体可用于作物抗性改良
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核心内容

该研究围绕禾谷镰刀菌毒素脱氧雪腐镰刀菌烯醇及其乙酰化衍生物15A-DON的转运输出问题展开。作者利用酿酒酵母PDR网络全部11个敲除菌株逐一评估各ABC转运蛋白的功能,确认Pdr5p是唯一能高效输出这两种毒素的蛋白,Δpdr5菌株在125 μg/mL DON或25 μg/mL 15A-DON下生长几乎完全受抑。随后对Pdr5p的S1360和T1364两个关键残基进行定点饱和突变,构建了38个单氨基酸替换突变体并测定其毒素输出能力和抑制剂抗性。结果显示,除S1360F、S1360W和T1364D外,其余突变体均维持高水平毒素输出;在FK506和enniatin B存在下,多个突变体如S1360D/E/K、T1364K等表现出显著优于野生型的生长。尤其在Fusarium avenaceum培养滤液加15A-DON的条件下,S1360D、S1360E、S1360K和T1364K仍能维持毒素输出。这些结果说明,通过定点突变可在不牺牲转运功能的前提下降低Pdr5p对抑制剂的敏感性,为作物镰刀菌抗性改良提供了有潜力的候选基因资源。

创新点

首次系统评估PDR网络所有ABC转运蛋白对DON和15A-DON的输出功能;对S1360和T1364残基构建了38个单氨基酸突变体,发现特定突变(如S1360D/E/K、T1364K)可在保持毒素输出的同时抵抗抑制剂,为植物抗性改良提供了候选基因。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Saccharomyces cerevisiae BY4741 PDR网络(pleiotropic drug resistance network) PDR5 Pdr5p 转运 主要输出DON和15A-DON;本研究对其S1360和T1364残基进行定点突变
Saccharomyces cerevisiae Δpdr5(BY4741衍生) PDR网络 PDR5变体(S1360X, T1364X) Pdr5p变体 转运 38个单氨基酸替换突变体,用于筛选保持毒素输出且抵抗抑制剂的变体
Saccharomyces cerevisiae(相应YKO敲除菌株) PDR网络 SNQ2, YOR1等10个已知/推定ABC转运蛋白基因 Snq2p, Yor1p等 转运 经表型筛选确认不参与DON和15A-DON输出
Fusarium avenaceum FaLH27 次生代谢产物合成 未指定 未指定 催化 产生enniatin等Pdr5p抑制剂,用于制备培养滤液测试突变体抗性

关键发现

  1. Pdr5p是PDR网络中唯一能输出DON和15A-DON的转运蛋白
  2. Δpdr5菌株在DON(125 μg/mL)或15A-DON(25 μg/mL)下生长几乎完全受抑。38个突变体中,除S1360F、S1360W、T1364D外,其余均维持高水平毒素输出。在FK506(20 μg/mL)存在下,S1360D/H/K/N/Q/Y和T1364E/N/P/Q等突变体保持高生长,而WT被严重抑制
  3. 在enniatin B(20 μg/mL)下,S1360D/E/K/Y和T1364E/K/P/R等高生长。在F. avenaceum FaLH27培养滤液+15A-DON(50 μg/mL)条件下,S1360D、S1360E、S1360K和T1364K的酵母生长显著优于WT。Pdr5p蛋白相对actin表达量比值范围为0.88至1.45,T1364D表达极低。

研究结论

Pdr5p是酵母中DON和15A-DON的主要输出者;通过对S1360/T1364进行定点突变,可以获得保持毒素输出且对Pdr5p抑制剂不敏感的突变体,特别是S1360D、S1360E、S1360K和T1364K在F. avenaceum培养滤液存在时仍能维持15A-DON输出,有望应用于作物镰刀菌抗性改良。

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