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Engineering of a Manganese-Binding Site in Lignin Peroxidase Isozyme H8 from Phanerochaete chrysosporium

作者
Tünde Mester, Ming Tien
单位
Department of Biochemistry and Molecular Biology, Pennsylvania State University, University Park, Pennsylvania 16802
杂志
Biochemical and Biophysical Research Communications(2001)
DOI
10.1006/bbrc.2001.5015
所属领域
酶工程
关键词
fungilignin degradationsite-directed mutagenesis
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解决的核心问题

木质素过氧化物酶(LP)缺乏锰结合位点,无法氧化Mn2+,而锰过氧化物酶(MnP)可以;本研究试图通过蛋白质工程在LP中构建锰结合位点,使其获得Mn2+氧化能力,探究底物特异性是否仅由底物结合位点决定。

研究策略

以MnP H4的Mn2+结合位点(Glu35、Glu39、Asp179)为模板,在重组LP同工酶H8中通过定点突变引入三个氨基酸替换(Asn182Asp、Asp183Lys、Ala36Glu),构建阴离子锰结合位点,并测定突变体的稳态动力学参数。

研究路线图

研究问题:LP缺乏锰结合位点,无法氧化Mn2+
策略:以MnP H4锰结合位点为模板,设计定点突变
关键改造:引入A36E/N182D/D183K三重突变
结果1:突变体获得Mn2+氧化活性(Km=1.57 mM)
结果2:保留藜芦醇氧化能力,但动力学参数改变
结果3:H2O2 Km降低,pH最适值升高约1个单位
结论:锰结合位点是LP与MnP底物特异性的关键结构差异
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核心内容

该研究通过蛋白质工程在木质素过氧化物酶同工酶H8中构建锰结合位点,以探究底物特异性是否仅由底物结合位点决定。研究者以锰过氧化物酶H4的锰结合位点为模板,在重组LPH8中引入Asn182Asp、Asp183Lys和Ala36Glu三个定点突变,形成阴离子锰结合位点。结果表明,三重突变体A36E/N182D/D183K获得了锰氧化活性,其Km(Mn²⁺)为1.57 mM,kcat为5.45 s⁻¹,催化效率为3.4×10³ M⁻¹·s⁻¹,而野生型及单突变、双突变体均无此活性。突变体保留了对藜芦醇的氧化能力,其Km(VA)为0.29 mM,kcat为1.1 s⁻¹。这证明在LP中引入MnP的锰结合位点足以赋予其锰氧化功能,揭示LP与MnP底物特异性的关键结构差异在于锰结合位点的有无,并为过氧化物酶双功能性与进化提供了结构基础。

创新点

首次在木质素过氧化物酶中通过设计锰结合位点成功构建出具有Mn2+氧化活性的双功能酶;支持了双功能过氧化物酶进化中'基因共享'模型的预测。

研究对象(3)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
E. coli BL21 木质素降解 LPH8 (ML-1) 木质素过氧化物酶同工酶H8(rLPH8) 催化 通过定点突变引入Asn182Asp、Asp183Lys、Ala36Glu三个突变,构建锰结合位点
Phanerochaete chrysosporium 木质素降解 MnP H4 锰过氧化物酶同工酶H4(MnP H4) 催化 作为对照,其天然锰结合位点由Glu35、Glu39、Asp179组成
Phanerochaete chrysosporium 木质素降解 lp (H8) Trp171 催化 参与藜芦醇等芳香底物的长程电子传递,在突变体中保留

关键发现

  1. 成功构建的三重突变体(A36E/N182D/D183K)能够氧化Mn2+,其Km(Mn2+)为1.57 mM,kcat为5.45 s-1,催化效率kcat/Km为3.4×10^3 M-1·s-1
  2. 而野生型rLPH8、单突变A36E和双突变N182D/D183K均无Mn2+氧化活性。突变体保留藜芦醇氧化能力,Km(VA)为0.29 mM,kcat为1.1 s-1,kcat/Km为3.8×10^3 M-1·s-1
  3. 野生型rLPH8对应Km为0.19 mM,kcat为2.2 s-1。突变体对H2O2的Km降至0.006 mM(野生型0.021 mM),但kcat/Km相近。突变体氧化藜芦醇和Mn2+的pH最适值均比野生型高约1个pH单位。

研究结论

在LP中引入MnP的Mn2+结合位点(三个酸性残基)足以赋予其Mn2+氧化活性,证明LP与MnP之间底物特异性的主要结构差异是锰结合位点的有无;创建替代底物结合位点可形成长程电子传递途径,为理解过氧化物酶双功能性和进化提供了结构基础。

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