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A regulated synthetic operon facilitates stable overexpression of multigene terpenoid pathway in Bacillus subtilis

作者
Ingy I. Abdallah, Dan Xue, Hegar Pramastya, Ronald van Merkerk, Rita Setroikromo, Wim J. Quax
单位
Department of Chemical and Pharmaceutical Biology, Groningen Research Institute of Pharmacy, University of Groningen; Pharmaceutical Biology Research Group, School of Pharmacy, Institut Teknologi Bandung
杂志
Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology(2020)
DOI
10.1007/s10295-019-02257-4
所属领域
代谢工程
关键词
Bacillus subtilisCarotenoidsCell factoryMEPStability
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解决的核心问题

在枯草芽孢杆菌中稳定过表达多基因萜类(MEP)途径,实现C30类胡萝卜素的高产

研究策略

构建包含MEP途径八个基因的合成操纵子,置于木糖诱导启动子下,采用theta复制质粒pHCMC04G实现稳定遗传;利用CPEC方法组装多基因,并比较不同复制方式的质粒稳定性

研究路线图

100%
研究问题:枯草芽孢杆菌稳定过表达多基因MEP途径
策略:构建八基因合成操纵子+theta复制质粒
关键改造1:CPEC法组装八基因MEP操纵子
关键改造2:theta复制质粒pHCMC04G实现稳定遗传
结果1:C30类胡萝卜素产量约21 mg/g dcw(对照20倍)
结果2:pHCMC04G质粒保持率>85%(100代无抗生素)
结果3:操纵子转录水平起始-中间-末端基本一致
结论:获得高产C30类胡萝卜素的稳定B. subtilis菌株
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核心内容

该研究在枯草芽孢杆菌中构建了包含MEP途径八个基因(dxs、ispD、ispH、ispF、ispC、ispE、ispG、ispA)的合成操纵子,置于木糖诱导启动子下,并采用theta复制质粒pHCMC04G实现稳定遗传。通过CPEC方法组装多基因,并比较了theta复制与滚动环复制质粒的稳定性差异。关键结果显示,携带完整八基因操纵子的p04SDFHCEGA菌株产生约21 mg/g dcw的C30类胡萝卜素,约为对照菌株的20倍;theta复制质粒在100代无抗生素培养后保持超过85%的质粒保持率,而滚动环复制质粒丢失超过70%。此外,theta复制质粒中操纵子的转录水平在起始、中间和末端区域基本一致,而滚动环复制质粒构建的八基因操纵子无法获得且10代后仅有57%和62%的正确序列。这一成果表明,利用稳定的theta复制质粒表达完整MEP途径可显著提高萜类产量,结合枯草芽孢杆菌的GRAS状态和快速生长特性,该菌株有望成为工业萜类化合物生产的细胞工厂。

创新点

首次在B. subtilis中基于质粒稳定表达完整八基因MEP操纵子;采用theta复制质粒克服滚动环复制质粒的不稳定性;实现了C30类胡萝卜素的高产(约21 mg/g dcw)

研究对象(8)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Bacillus subtilis 168 MEP途径 dxs 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶 (Dxs) 催化 MEP途径第一个酶,催化丙酮酸和甘油醛-3-磷酸缩合
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispD 2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸胞苷转移酶 (IspD) 催化 MEP途径酶
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispH 4-羟基-3-甲基丁-2-烯基二磷酸还原酶 (IspH) 催化 MEP途径酶
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispF 2-C-甲基-D-赤藓醇-2,4-环二磷酸合酶 (IspF) 催化 MEP途径酶
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispC 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶 (IspC) 催化 MEP途径酶
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispE 4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶 (IspE) 催化 MEP途径酶
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispG 4-羟基-3-甲基丁-2-烯基二磷酸合酶 (IspG) 催化 MEP途径酶
Bacillus subtilis 168 MEP途径 ispA 法尼基焦磷酸合酶 (IspA) 催化 催化IPP和DMAPP缩合生成FPP,为C30类胡萝卜素提供前体

关键发现

p04SDFHCEGA菌株(过表达dxs, ispD, ispH, ispF, ispC, ispE, ispG, ispA八基因)产生约21 mg/g dcw类胡萝卜素,约为含pHYCrTMN对照菌株的20倍。theta复制质粒(pHCMC04G)在100代无抗生素培养后保持>85%的质粒保持率,而滚动环复制质粒(pHB201)丢失>70%。pHCMC04G菌株的操纵子转录水平在起始、中间和末端基本一致。pHB201构建的八基因操纵子无法获得,且10代后仅有57%和62%正确序列。

研究结论

成功构建了稳定过表达完整MEP途径的B. subtilis菌株,显著提高了C30类胡萝卜素产量,结合其GRAS状态和快速生长,有望成为生产萜类化合物的工业细胞工厂。