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Characterization of alcohol dehydrogenase from Kangiella koreensis and its application to production of all-trans-retinol

作者
Seung-Hye Hong, Ho-Phuong-Thuy Ngo, Lin-Woo Kang, Deok-Kun Oh
单位
Department of Bioscience and Biotechnology, Konkuk University, 1 Hwayang-dong, Gwangjin-gu, Seoul 143-701, Republic of Korea; Department of Biological Science, Konkuk University, 1 Hwayang-dong, Gwangjin-g, Seoul 143-701, Republic of Korea
杂志
Biotechnology Letters(2014)
DOI
10.1007/s10529-014-1740-x
所属领域
酶工程
关键词
Kangiella koreensis全反式视黄醇全反式视黄醛酒精脱氢酶酶表征
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解决的核心问题

化学合成维甲类化合物存在纯化步骤复杂、产生化学废弃物和副产物等缺点,需要开发生物技术方法生产全反式视黄醇。本文旨在表征来自Kangiella koreensis的酒精脱氢酶(ADH)并用于全反式视黄醇的生物法生产。

研究策略

克隆并表达K. koreensis的ADH基因,纯化重组酶,表征其底物特异性和动力学参数,优化由全反式视黄醛还原为全反式视黄醇的反应条件(pH、温度、底物和酶浓度),并在优化条件下进行时间进程反应。

研究路线图

100%
研究问题:生化法生产全反式视黄醇替代化学合成
策略:克隆表达K. koreensis ADH并表征酶学性质
改造①:ADH基因克隆·重组蛋白表达·His标签纯化
改造②:底物特异性/Km/kcat等酶学表征
改造③:优化pH/温度/底物·酶浓度反应条件
结果:3h产600 mg/L视黄醇,转化率27.3%,生产力200 mg/L/h
结论:首个ADH用于视黄醇生物生产,可组合Blh实现从β-胡萝卜素生物合成
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核心内容

本研究从海洋细菌Kangiella koreensis中克隆并表达了酒精脱氢酶(ADH)基因,在Escherichia coli ER2566中实现重组表达并纯化了带His标签的酶蛋白。对重组酶的酶学性质进行了系统表征,发现该酶以40 kDa二聚体形式存在,对全反式视黄醛的比活为21.3 nmol min⁻¹ mg⁻¹,Km为1.8 μM,kcat为1.7 min⁻¹,最适pH 6.5,最适温度60 °C,且不依赖金属离子、不受EDTA影响。氨基酸序列与多种动物ADH具有48.9%–70.5%的一致性,显示较高同源性。在优化反应条件(2,200 mg/L全反式视黄醛、2 g/L酶、5%甲醇、1%氢醌、10 mM NADH)下,3小时内可生产600 mg/L全反式视黄醇,转化率为27.3%(w/w),生产力达200 mg L⁻¹ h⁻¹。该研究首次报道了细菌ADH对全反式视黄醛的酶学特性,并证明其可用于全反式视黄醇的生物技术生产,为后续与β-胡萝卜素单加氧酶组合、实现从β-胡萝卜素或甘油到视黄醇的全生物合成奠定了基础。

创新点

首次对细菌ADH针对全反式视黄醛的酶学性质进行表征;首次利用ADH实现全反式视黄醇的生物技术生产;发现K. koreensis ADH与动物ADH有较高序列同源性(49-79%)。

研究对象(2)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Kangiella koreensis SW-125 视黄醇代谢 ADH基因(GenBank登陆号ACV27458.1) 酒精脱氢酶(ADH) 催化 基因来源菌株,催化全反式视黄醛还原为全反式视黄醇,以NADH为辅因子。
Escherichia coli ER2566 重组蛋白表达 重组ADH基因 重组ADH(带His标签) 催化 用于酶表征和全反式视黄醇生产,优化条件下产量为600 mg/L。

关键发现

重组K. koreensis ADH以40 kDa二聚体形式存在,对全反式视黄醛的比活为21.3 nmol min⁻¹ mg⁻¹,Km为1.8 μM,kcat为1.7 min⁻¹,kcat/Km为0.95 μM⁻¹ min⁻¹。最适pH 6.5,最适温度60 °C。在优化条件下(2,200 mg all-trans-retinal/L,2 g酶/L,5%甲醇,1%氢醌,10 mM NADH),3 h内产生600 mg all-trans-retinol/L,转化率27.3% (w/w),生产力200 mg L⁻¹ h⁻¹。酶不依赖金属离子,不受EDTA影响。氨基酸序列与鱼、大鼠、小鼠、马和蛙的ADH一致性分别为70.5%、53.5%、51.1%、53.5%和48.9%。

研究结论

K. koreensis ADH是首个用于全反式视黄醇生物技术生产的细菌ADH,可进一步与β-胡萝卜素单加氧酶(Blh)或工程菌组合,实现从β-胡萝卜素或甘油生物合成全反式视黄醇。