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Isolation, characterization and evaluation of hyper 2-propanol producing bacteria from Singapore environment

作者
Zhi Rui Ng, Katsuyuki Takahashi, Zhibin Liu
单位
Institute of Chemical and Engineering Sciences, 1 Pesek Road, Jurong Island, Singapore 627833, Singapore; Abbott Laboratories Singapore, Neuros #03-01, 8 Biomedical Grove, Singapore 138665, Singapore; Mitsui Chemical Singapore R&D Centre, Pte. Ltd., #06-08/11 The Kendall, 50 Science Park Road, Singapore Science Park II, Singapore 117406, Singapore
杂志
World Journal of Microbiology and Biotechnology(2013)
DOI
10.1007/s11274-013-1269-5
所属领域
发酵工程
关键词
2-PropanolClostridiumFermentationIsolationSingapore
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解决的核心问题

现有天然2-丙醇生产菌株(如Clostridium beijerinckii NRRL B593)的2-丙醇产量和产率低,难以满足工业化需求,需从环境中筛选高效生产菌株。

研究策略

从新加坡环境采集土壤样本,利用含淀粉的培养基富集梭菌,随后通过24孔板高通量培养和碘液检测丙酮(2-丙醇前体)的反应,筛选出2-丙醇产量比NRRL B593高50%以上的菌株,并在2L发酵罐中进行1L规模发酵验证。

研究路线图

100%
研究问题
天然菌株2-丙醇产量低
策略
环境采样+高通量筛选
改进1
丙酮-碘显色快速检测法
改进2
24孔板高密度筛选平台
关键结果
获3株超高产梭菌
验证
2L罐1L规模发酵
结论
高效天然2-丙醇生产者
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核心内容

研究人员从新加坡环境土壤中分离并筛选高效生产2-丙醇的天然梭菌菌株。首先利用含淀粉培养基富集梭菌,随后开发了基于丙酮-碘显色反应的高通量筛选方法,在24孔板中快速鉴定出三株2-丙醇产量显著高于已知最有效天然生产者Clostridium beijerinckii NRRL B593的菌株。经2L发酵罐1L规模验证,菌株BT10-6、M10-1和PU31-4的2-丙醇产量分别达5.26、4.10和4.29 g/L,为B593(2.56 g/L)的1.6至2.1倍;产率分别为0.132、0.118和0.087 g/L/h,是B593(0.029 g/L/h)的3.0至4.6倍。三株菌的葡萄糖在40至48小时内几乎完全消耗,其丁醇产率也较对照菌株NCIMB 8052提升1.4至1.7倍。这些分离自新加坡环境的梭菌属菌株表现出远超现有天然菌株的2-丙醇合成效率,具备替代石化法生产2-丙醇的潜力,可作为工程改造的出发菌株,通过删除副产物途径或结合原位产物回收进一步优化。

创新点

开发了基于丙酮-碘显色反应的高通量筛选方法;首次从新加坡环境分离得到三株超高产2-丙醇的梭菌(Clostridium sp. BT10-6, M10-1, PU31-4),其2-丙醇产量和产率显著超过已知最有效的天然生产者。

研究对象(5)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Clostridium sp. BT10-6 2-丙醇/丁醇/丙酮发酵途径(糖酵解-丙酮酸-乙酰CoA分支) 催化 分离自新加坡土壤,在2L发酵罐中1L规模发酵40h产2-丙醇5.26 g/L,产率0.132 g/L/h,为最高产量菌株。
Clostridium sp. M10-1 2-丙醇/丁醇/丙酮发酵途径(糖酵解-丙酮酸-乙酰CoA分支) 催化 分离自新加坡土壤,2-丙醇产量4.10 g/L,产率0.118 g/L/h。
Clostridium sp. PU31-4 2-丙醇/丁醇/丙酮发酵途径(糖酵解-丙酮酸-乙酰CoA分支) 催化 分离自新加坡土壤,2-丙醇产量4.29 g/L,产率0.087 g/L/h。
Clostridium beijerinckii NRRL B593 2-丙醇/丁醇/丙酮发酵途径 催化 已知最有效的天然2-丙醇生产菌株,作为2-丙醇对照菌,2-丙醇产量2.56 g/L,产率0.029 g/L/h。
Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 丁醇/丙酮/乙醇发酵途径 催化 丁醇对照菌株,丁醇产率0.146 g/L/h。

关键发现

  1. 三株阳性菌BT10-6、M10-1和PU31-4在1L发酵规模下2-丙醇产量分别为5.26 g/L、4.10 g/L和4.29 g/L,是C. beijerinckii NRRL B593(2.56 g/L)的1.6-2.1倍
  2. 2-丙醇产率分别为0.132、0.118和0.087 g/L/h,是B593(0.029 g/L/h)的3.0-4.6倍
  3. 葡萄糖在40-48h内几乎完全消耗。丁醇产率分别为0.253、0.239和0.212 g/L/h,是对照C. beijerinckii NCIMB 8052(0.146 g/L/h)的1.4-1.7倍
  4. 三株菌的最高OD600接近对照菌(约12-13.5)。

研究结论

分离得到的三株Clostridium属菌株是高效的天然2-丙醇生产者,具有替代石化法生产2-丙醇的潜力,可通过删除副产物途径或结合原位产物回收技术进一步提升产量,也可作为工程菌改造的出发菌株。