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Characterization of a butanol-acetone-producing Clostridium strain and identification of its solventogenic genes

作者
Teck Khiang Chua, Da-Wei Liang, Chao Qi, Kun-Lin Yang, Jianzhong He
单位
Department of Civil and Environmental Engineering, National University of Singapore; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, National University of Singapore
杂志
Bioresource Technology(2012)
DOI
10.1016/j.biortech.2012.08.085
所属领域
发酵工程
关键词
BiofuelButanolButanol dehydrogenaseClostridiumSolventogenic
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解决的核心问题

筛选和表征一株高产丁醇、几乎不产乙醇的新型野生型梭菌,并鉴定其丁醇脱氢酶基因,以降低丁醇生产成本、简化分离纯化工艺。

研究策略

从新加坡草地上壤中分离丙酮/丁醇产生菌,通过16S rRNA系统发育分析鉴定菌株G117;优化pH和酵母提取物浓度等发酵条件;设计简并引物克隆推定bdh基因,利用qPCR测定其转录水平。

研究路线图

100%
研究问题:筛选高产丁醇、低乙醇的新型梭菌
策略:土壤分离,16S rRNA鉴定菌株G117
策略:优化pH与酵母提取物发酵条件
关键改造:简并引物克隆推定bdh基因
关键改造:qPCR测定bdh转录水平
结果:丁醇13.50 g/L,产率30.38%
结果:几乎不产乙醇,丁醇/丁酸13.87
结果:bdh在10小时转录上调约200倍
结论:G117可作工业丁醇生产菌株,bdh是关键基因
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核心内容

从新加坡草地上壤中分离到一株新型野生型梭菌Clostridium sp. strain G117,经16S rRNA系统发育分析鉴定其种属地位。通过优化发酵条件,该菌株在60 g/L葡萄糖和0.4%酵母提取物条件下产丁醇13.50 g/L,产率30.38%(g丁醇/g葡萄糖消耗),较野生型C. acetobutylicum ATCC 824的11.25 g/L提高约20%,且发酵产物几乎不含乙醇,形成独特的丙酮-丁醇发酵谱。在30 g/L葡萄糖、pH 6.0条件下,丁醇产量达8.52 g/L,丁醇/丁酸摩尔比高达13.87。利用简并引物克隆推定丁醇脱氢酶基因bdh,其序列与C. beijerinckii NCIMB 8052的bdh1和bdh2一致性分别为98%和90%,编码蛋白含铁离子依赖性乙醇脱氢酶特征基序。qPCR显示bdh基因在培养10小时后转录水平较零时上调约200倍。该菌株高效产丁醇且几乎不产乙醇的特性简化了分离纯化工艺,具备工业生物丁醇生产潜力,高表达的bdh基因推测为丁醇合成的关键基因。

创新点

获得新型野生型Clostridium sp. strain G117,其丁醇产量较野生型C. acetobutylicum ATCC 824提高约20%;发酵产物中几乎不含乙醇,形成独特的丙酮-丁醇(AB)发酵谱;鉴定到推定bdh基因,其转录水平在培养10小时后上调约200倍。

研究对象(1)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Clostridium sp. strain G117 丙酮-丁醇发酵途径 bdh 丁醇脱氢酶(BDH) 催化 催化丁醛还原为丁醇,为丁醇合成最后一步关键酶;含ADH-IRON 1和2保守基序,与C. beijerinckii NCIMB 8052 BDH1/2高度同源。

关键发现

  1. G117在60 g/L葡萄糖、0.4%酵母提取物条件下产丁醇13.50 g/L,产率30.38%(g丁醇/g葡萄糖消耗),较野生型C. acetobutylicum ATCC 824的11.25 g/L高约20%
  2. 在30 g/L葡萄糖、pH 6.0、0.4%酵母提取物时丁醇产量8.52 g/L,产率28.56,丁醇/丁酸摩尔比达13.87
  3. 不添加酵母提取物时丁醇产量6.45 g/L,产率23.83%。G117的bdh基因与C. beijerinckii NCIMB 8052的bdh1和bdh2序列一致性分别为98%和90%,编码蛋白含铁离子依赖性乙醇脱氢酶特征基序ADH-IRON 1和2
  4. qPCR显示bdh基因在10小时转录水平较零时上调约200倍。

研究结论

野生型Clostridium sp. strain G117能高效发酵葡萄糖生产丁醇和丙酮,几乎不产乙醇,具备工业生物丁醇生产的潜力;其bdh基因高表达,推测是参与丁醇生成的关键基因。