Expression analysis of Cell wall invertase under abiotic stress conditions influencing specialized metabolism in Catharanthus roseus
- 作者
- M. J. Nishanth, S. A. Sheshadri, Sudarshan Singh Rathore, S. Srinidhi, Bindu Simon
- 杂志
- Scientific Reports(2018)
- DOI
- 10.1038/s41598-018-33415-w
- 所属领域
- 代谢工程
- 关键词
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解决的核心问题
解析细胞壁转化酶(CWIN)在非生物胁迫下对长春花(Catharanthus roseus)中萜类吲哚生物碱(TIA)等特殊代谢物合成的调控作用,寻找提高抗癌TIA含量的代谢工程靶点。
研究策略
通过同源比对鉴定长春花CWIN基因家族并进行生物信息学分析;利用qRT-PCR分析不同组织及冷、旱、盐、UV、创伤和蔗糖处理下CWIN、蔗糖代谢、TIA生物合成及苯丙烷代谢相关基因的表达;通过HPLC检测代谢物变化;在本氏烟草中瞬时过表达CrCWIN2进行跨物种功能验证。
核心内容
该研究以药用植物长春花为对象,系统解析了细胞壁转化酶(CWIN)在非生物胁迫下对萜类吲哚生物碱(TIA)等特殊代谢物合成的调控作用。通过同源比对鉴定出长春花基因组中3个CWIN亚型,其中CrCWIN2是唯一含完整NDPNG催化位点的功能性转化酶,CDS长1725 bp,编码574个氨基酸(65.0 kDa),在根中表达量最高。qRT-PCR分析显示,外源蔗糖处理可显著上调CrCWIN2及G10H、SLS、TDC、STR等TIA生物合成基因,同时使文多灵和长春质碱含量明显增加;冷、旱、盐胁迫下各CWIN亚型及蔗糖代谢基因呈现差异化响应。在本氏烟草中瞬时过表达CrCWIN2使转录本积累138倍、CWIN活性约为对照2.2倍,并显著激活NbPAL2、Nb4CL、NbCHS等苯丙烷代谢基因及肉桂酸、香豆素等代谢物积累。结果表明CWIN是连接初生蔗糖代谢与TIA生物合成的关键节点,通过调控CWIN表达或外源蔗糖供给可有效提高抗癌TIA前体含量,为长春花代谢工程改良提供了新靶点。
创新点
首次在药用植物长春花中系统表征CWIN基因的表达与调控;发现外源蔗糖可协同上调CrCWIN2与TIA生物合成基因并显著增加单体TIA含量;异源过表达CrCWIN2可激活本氏烟草中多种特殊代谢基因。
研究对象(31)
| 底盘细胞 | 代谢通路 | 基因 | 蛋白 | 功能 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|
| Catharanthus roseus | 蔗糖代谢 | CrCWIN1 | — | 催化 | 缺乏NDPNG蔗糖结合盒,预测为缺陷型转化酶 |
| Catharanthus roseus | 蔗糖代谢 | CrCWIN2 | — | 催化 | 唯一含完整催化位点(NDPNG/WECP/RDP)的功能性CWIN,根中表达最高 |
| Catharanthus roseus | 蔗糖代谢 | CrCWIN3 | — | 催化 | 缺乏NDPNG基序,预测为缺陷型转化酶 |
| Catharanthus roseus | 蔗糖代谢 | SUSY | 蔗糖合酶 | 催化 | 蔗糖合成相关,冷胁迫下上调 |
| Catharanthus roseus | 蔗糖代谢 | SPS | 蔗糖磷酸合酶 | 催化 | 蔗糖合成相关,冷胁迫下下调 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | G10H | 香叶醇10-羟化酶 | 催化 | 蔗糖处理显著诱导 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | DAT | 脱乙酰氨基文多灵4-O-乙酰转移酶 | 催化 | 盐胁迫下下调 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | SLS | 断马钱子苷合酶 | 催化 | 蔗糖和冷胁迫下显著上调 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | PRX1 | 过氧化物酶 | 催化 | 多种胁迫下上调,兼抗氧化功能 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | DXS | 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶 | 催化 | 蔗糖和创伤胁迫下上调 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | TDC | 色氨酸脱羧酶 | 催化 | 盐、冷、UV和蔗糖处理下上调 |
| Catharanthus roseus | 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 | STR | 异胡豆苷合酶 | 催化 | 多种胁迫下显著上调 |
| Catharanthus roseus | TIA生物合成调控 | ORCA3 | AP2/ERF转录因子 | 调控 | 蔗糖、UV、盐和干旱处理下下调 |
| Catharanthus roseus | 苯丙烷代谢 | PAL | 苯丙氨酸解氨酶 | 催化 | 蔗糖和盐胁迫下上调 |
| Catharanthus roseus | 苯丙烷代谢 | C4H | 肉桂酸4-羟化酶 | 催化 | 蔗糖处理显著上调 |
| Catharanthus roseus | 苯丙烷代谢 | CHS | 查尔酮合酶 | 催化 | UV和盐胁迫下下调 |
| Catharanthus roseus | 抗氧化防御 | CAT | 过氧化氢酶 | 催化 | 冷胁迫和蔗糖处理下下调 |
| Catharanthus roseus | 抗氧化防御 | SOD | 超氧化物歧化酶 | 催化 | UV胁迫下上调 |
| Nicotiana benthamiana | 蔗糖代谢 | NbCWIN3 | 细胞壁转化酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 蔗糖代谢 | NbSPS1 | 蔗糖磷酸合酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后下调 |
| Nicotiana benthamiana | 蔗糖代谢 | NbSUSY | 蔗糖合酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后下调 |
| Nicotiana benthamiana | 苯丙烷代谢 | NbPAL2 | 苯丙氨酸解氨酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 苯丙烷代谢 | Nb4CL | 4-香豆酸-CoA连接酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 苯丙烷代谢 | NbCHS | 查尔酮合酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 苯丙烷代谢 | NbF3H | 黄烷酮3-羟化酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 苯丙烷代谢 | NbANS | 花青素合酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 苯丙烷代谢 | NbHCT | 莽草酸/羟基肉桂酰转移酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后显著上调 |
| Nicotiana benthamiana | 异戊二烯代谢 | NbG10H | 香叶醇10-羟化酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后上调 |
| Nicotiana benthamiana | 异戊二烯代谢 | NbDXR | 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后下调 |
| Nicotiana benthamiana | 异戊二烯代谢 | NbDXS | 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后下调 |
| Nicotiana benthamiana | 异戊二烯代谢 | NbHDS | 4-羟基-3-甲基丁-2-烯-1-基二磷酸合酶 | 催化 | CrCWIN2过表达后上调 |
关键发现
- 长春花基因组中存在3个CWIN亚型(CrCWIN1/2/3),其中CrCWIN2是唯一包含完整NDPNG催化位点的功能性转化酶,CDS长1725 bp,编码574个氨基酸(65.0 kDa),在根中相对表达量最高(11.18)。蔗糖处理显著上调CrCWIN2及TIA基因(G10H、SLS、TDC、STR、DXS、PRX1),同时显著增加文多灵和长春质碱的含量。在本氏烟草中瞬时过表达CrCWIN2导致转录本积累138倍,CWIN活性约为对照的2.2倍,并显著上调NbPAL2、Nb4CL、NbCHS、NbF3H、NbANS、NbHCT、NbG10H等基因,以及肉桂酸、香豆素、非瑟酮等代谢物。冷胁迫下CrCWIN1、CrCWIN3和SUSY上调而SPS下调
- 盐胁迫下CrCWIN1和CrCWIN2上调
- 干旱胁迫下多数基因下调。
研究结论
蔗糖代谢与特殊代谢密切相关,CWIN是连接初生代谢与TIA生物合成的关键节点。通过调控CWIN表达或外源蔗糖供给可显著提高长春花中单体TIA前体(文多灵、长春质碱)的积累,为抗癌药物前体的代谢工程改良提供了新策略。