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Expression analysis of Cell wall invertase under abiotic stress conditions influencing specialized metabolism in Catharanthus roseus

作者
M. J. Nishanth, S. A. Sheshadri, Sudarshan Singh Rathore, S. Srinidhi, Bindu Simon
杂志
Scientific Reports(2018)
DOI
10.1038/s41598-018-33415-w
所属领域
代谢工程
关键词
Catharanthus roseusCell wall invertaseabiotic stressspecialized metabolismterpenoid indole alkaloids
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解决的核心问题

解析细胞壁转化酶(CWIN)在非生物胁迫下对长春花(Catharanthus roseus)中萜类吲哚生物碱(TIA)等特殊代谢物合成的调控作用,寻找提高抗癌TIA含量的代谢工程靶点。

研究策略

通过同源比对鉴定长春花CWIN基因家族并进行生物信息学分析;利用qRT-PCR分析不同组织及冷、旱、盐、UV、创伤和蔗糖处理下CWIN、蔗糖代谢、TIA生物合成及苯丙烷代谢相关基因的表达;通过HPLC检测代谢物变化;在本氏烟草中瞬时过表达CrCWIN2进行跨物种功能验证。

研究路线图

100%
研究问题
解析CWIN在非生物胁迫下调控长春花TIA合成的机制
策略
家族鉴定、表达分析、代谢检测、跨物种验证
关键改造
筛选CrCWIN2并异源过表达
关键结果
蔗糖协同上调CrCWIN2与TIA基因,增加文多灵/长春质碱
结论
CWIN是连接初生代谢与TIA合成的代谢工程靶点
验证与展望
瞬时过表达激活多种特殊代谢基因与代谢物
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核心内容

该研究以药用植物长春花为对象,系统解析了细胞壁转化酶(CWIN)在非生物胁迫下对萜类吲哚生物碱(TIA)等特殊代谢物合成的调控作用。通过同源比对鉴定出长春花基因组中3个CWIN亚型,其中CrCWIN2是唯一含完整NDPNG催化位点的功能性转化酶,CDS长1725 bp,编码574个氨基酸(65.0 kDa),在根中表达量最高。qRT-PCR分析显示,外源蔗糖处理可显著上调CrCWIN2及G10H、SLS、TDC、STR等TIA生物合成基因,同时使文多灵和长春质碱含量明显增加;冷、旱、盐胁迫下各CWIN亚型及蔗糖代谢基因呈现差异化响应。在本氏烟草中瞬时过表达CrCWIN2使转录本积累138倍、CWIN活性约为对照2.2倍,并显著激活NbPAL2、Nb4CL、NbCHS等苯丙烷代谢基因及肉桂酸、香豆素等代谢物积累。结果表明CWIN是连接初生蔗糖代谢与TIA生物合成的关键节点,通过调控CWIN表达或外源蔗糖供给可有效提高抗癌TIA前体含量,为长春花代谢工程改良提供了新靶点。

创新点

首次在药用植物长春花中系统表征CWIN基因的表达与调控;发现外源蔗糖可协同上调CrCWIN2与TIA生物合成基因并显著增加单体TIA含量;异源过表达CrCWIN2可激活本氏烟草中多种特殊代谢基因。

研究对象(31)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Catharanthus roseus 蔗糖代谢 CrCWIN1 催化 缺乏NDPNG蔗糖结合盒,预测为缺陷型转化酶
Catharanthus roseus 蔗糖代谢 CrCWIN2 催化 唯一含完整催化位点(NDPNG/WECP/RDP)的功能性CWIN,根中表达最高
Catharanthus roseus 蔗糖代谢 CrCWIN3 催化 缺乏NDPNG基序,预测为缺陷型转化酶
Catharanthus roseus 蔗糖代谢 SUSY 蔗糖合酶 催化 蔗糖合成相关,冷胁迫下上调
Catharanthus roseus 蔗糖代谢 SPS 蔗糖磷酸合酶 催化 蔗糖合成相关,冷胁迫下下调
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 G10H 香叶醇10-羟化酶 催化 蔗糖处理显著诱导
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 DAT 脱乙酰氨基文多灵4-O-乙酰转移酶 催化 盐胁迫下下调
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 SLS 断马钱子苷合酶 催化 蔗糖和冷胁迫下显著上调
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 PRX1 过氧化物酶 催化 多种胁迫下上调,兼抗氧化功能
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 DXS 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶 催化 蔗糖和创伤胁迫下上调
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 TDC 色氨酸脱羧酶 催化 盐、冷、UV和蔗糖处理下上调
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱(TIA)生物合成 STR 异胡豆苷合酶 催化 多种胁迫下显著上调
Catharanthus roseus TIA生物合成调控 ORCA3 AP2/ERF转录因子 调控 蔗糖、UV、盐和干旱处理下下调
Catharanthus roseus 苯丙烷代谢 PAL 苯丙氨酸解氨酶 催化 蔗糖和盐胁迫下上调
Catharanthus roseus 苯丙烷代谢 C4H 肉桂酸4-羟化酶 催化 蔗糖处理显著上调
Catharanthus roseus 苯丙烷代谢 CHS 查尔酮合酶 催化 UV和盐胁迫下下调
Catharanthus roseus 抗氧化防御 CAT 过氧化氢酶 催化 冷胁迫和蔗糖处理下下调
Catharanthus roseus 抗氧化防御 SOD 超氧化物歧化酶 催化 UV胁迫下上调
Nicotiana benthamiana 蔗糖代谢 NbCWIN3 细胞壁转化酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 蔗糖代谢 NbSPS1 蔗糖磷酸合酶 催化 CrCWIN2过表达后下调
Nicotiana benthamiana 蔗糖代谢 NbSUSY 蔗糖合酶 催化 CrCWIN2过表达后下调
Nicotiana benthamiana 苯丙烷代谢 NbPAL2 苯丙氨酸解氨酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 苯丙烷代谢 Nb4CL 4-香豆酸-CoA连接酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 苯丙烷代谢 NbCHS 查尔酮合酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 苯丙烷代谢 NbF3H 黄烷酮3-羟化酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 苯丙烷代谢 NbANS 花青素合酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 苯丙烷代谢 NbHCT 莽草酸/羟基肉桂酰转移酶 催化 CrCWIN2过表达后显著上调
Nicotiana benthamiana 异戊二烯代谢 NbG10H 香叶醇10-羟化酶 催化 CrCWIN2过表达后上调
Nicotiana benthamiana 异戊二烯代谢 NbDXR 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶 催化 CrCWIN2过表达后下调
Nicotiana benthamiana 异戊二烯代谢 NbDXS 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶 催化 CrCWIN2过表达后下调
Nicotiana benthamiana 异戊二烯代谢 NbHDS 4-羟基-3-甲基丁-2-烯-1-基二磷酸合酶 催化 CrCWIN2过表达后上调

关键发现

  1. 长春花基因组中存在3个CWIN亚型(CrCWIN1/2/3),其中CrCWIN2是唯一包含完整NDPNG催化位点的功能性转化酶,CDS长1725 bp,编码574个氨基酸(65.0 kDa),在根中相对表达量最高(11.18)。蔗糖处理显著上调CrCWIN2及TIA基因(G10H、SLS、TDC、STR、DXS、PRX1),同时显著增加文多灵和长春质碱的含量。在本氏烟草中瞬时过表达CrCWIN2导致转录本积累138倍,CWIN活性约为对照的2.2倍,并显著上调NbPAL2、Nb4CL、NbCHS、NbF3H、NbANS、NbHCT、NbG10H等基因,以及肉桂酸、香豆素、非瑟酮等代谢物。冷胁迫下CrCWIN1、CrCWIN3和SUSY上调而SPS下调
  2. 盐胁迫下CrCWIN1和CrCWIN2上调
  3. 干旱胁迫下多数基因下调。

研究结论

蔗糖代谢与特殊代谢密切相关,CWIN是连接初生代谢与TIA生物合成的关键节点。通过调控CWIN表达或外源蔗糖供给可显著提高长春花中单体TIA前体(文多灵、长春质碱)的积累,为抗癌药物前体的代谢工程改良提供了新策略。