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Molecular characterization and safety assessment of biofortified provitamin A rice

作者
Norman Oliva, Maria Florida Cueto-Reano, Kurniawan R. Trijatmiko, Mercy Samia, Ralf Welsch, Patrick Schaub, Peter Beyer, Donald Mackenzie, Raul Boncodin, Russell Reinke, Inez Slamet-Loedin, B. P. Mallikarjuna Swamy
杂志
Scientific Reports(2020)
DOI
10.1038/s41598-020-57669-5
所属领域
代谢工程
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解决的核心问题

对维生素A原生物强化水稻(Golden Rice)事件GR2E进行全面的分子特征描述和安全性评估,包括插入DNA的拷贝数、完整性、遗传稳定性,以及新表达蛋白ZmPSY1和CRTI的潜在致敏性与毒性,以支持其作为安全食品的监管审批。

研究策略

采用Southern blot分析插入DNA的拷贝数与完整性,通过全长测序验证插入序列及旁侧序列;用生物信息学比对评估新表达蛋白及连接区新ORF与过敏原/毒素的同源性;通过模拟胃液消化实验、热稳定性实验和小鼠急性口服毒性实验评估蛋白安全性;并用ELISA测定蛋白表达量以估算膳食暴露量。

研究路线图

研究问题:维生素A原
生物强化水稻安全性评估
策略:分子特征鉴定
+ 蛋白安全性分析
策略:全基因组测序
与拷贝数分析
关键改造:单拷贝插入
无质粒骨架,多代稳定
关键改造:生物信息学
致敏性/毒性同源性比对
关键改造:模拟胃液消化
热稳定性与动物毒性实验
结果:ZmPSY1/CRTI
无致敏性、无毒风险
结果:类胡萝卜素含量
不同背景下稳定表达
结论:GR2E与常规水稻
同样安全,可缓解VitA缺乏
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核心内容

该研究对维生素A原生物强化水稻(Golden Rice)事件GR2E进行了系统的分子特征鉴定与安全性评估。通过Southern blot和全长测序证实T-DNA以单拷贝形式插入水稻3号染色体基因间区,无质粒骨架残留,侧翼序列及插入序列共12772 bp,左右边界分别缺失11 bp和23 bp,且多代遗传稳定。在类胡萝卜素含量方面,不同遗传背景籽粒总类胡萝卜素为13.23至30.50 μg/g鲜重。针对新表达蛋白ZmPSY1和CRTI的评估显示,两者在模拟胃液中30秒内完全降解,热稳定性差(ZmPSY1在50°C、CRTI在55°C即完全失活),CRTI以100 mg/kg体重剂量口服未致小鼠不良效应;生物信息学比对未发现显著过敏原或毒素同源序列。估算每日最大膳食暴露量ZmPSY1约4.49 μg/kg体重、CRTI约0.85 μg/kg体重。综合证据表明该事件分子特征明确、遗传稳定,新表达蛋白缺乏致敏和毒性潜能,与传统水稻安全性相当,可支持其作为缓解维生素A缺乏症的食品安全监管审批。

创新点

首次系统报道Golden Rice事件GR2E的分子鉴定与安全性评估数据,包括单拷贝插入、无质粒骨架、多代稳定遗传,以及通过多重证据(序列相似性、消化稳定性、热敏感性、动物毒性)为新蛋白ZmPSY1和CRTI提供安全证据。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Oryza sativa (水稻) 类胡萝卜素生物合成 Zmpsy1 ZmPSY1 催化 来源于玉米,催化GGPP生成15-顺式八氢番茄红素;受胚乳特异性GluA-2启动子调控。
Oryza sativa (水稻) 类胡萝卜素生物合成 crtI (SSU-crtI融合基因) CRTI 催化 来源于Pantoea ananatis,催化八氢番茄红素去饱和生成番茄红素;N端融合豌豆RUBISCO SSU转运肽,受GluA-2启动子调控。
Oryza sativa (水稻) 选择标记/甘露糖代谢 pmi PMI 催化 来源于大肠杆菌的磷酸甘露糖异构酶,用作转基因筛选标记;受组成型玉米多聚泛素启动子调控。
Oryza sativa (水稻) 蛋白质靶向转运 SSU (豌豆RUBISCO小亚基转运肽编码序列) SSU转运肽 区室化 引导CRTI蛋白进入质体以实现类胡萝卜素合成。

关键发现

  1. Southern blot证实GR2E基因组中T-DNA为单拷贝插入于单一基因座,未检测到质粒骨架序列
  2. HindIII消化产生约7900 bp(Zmpsy1/pmi探针)和约7200 bp(SSU-crtI探针)片段,SphI产生约6900 bp和约5500 bp片段。全长测序共确定12772 bp序列,包括5'侧翼1988 bp、3'侧翼1788 bp和插入T-DNA 8996 bp
  3. T-DNA左右边界分别缺失11 bp和23 bp,其余序列与pSYN12424质粒一致
  4. 插入位于水稻3号染色体LOC_Os03g43980与LOC_Os03g43990之间的基因间区。类胡萝卜素含量:Kaybonnet背景Tn代总类胡萝卜素为30.50±2.49 μg/g FWT
  5. BC5F5代在BRRI dhan29背景为29.33±3.14 μg/g FWT,在PSBRc82为14.12±0.11 μg/g FWT,IR64为13.23±1.16 μg/g FWT。ZmPSY1和CRTI蛋白在含胃蛋白酶的模拟胃液中30秒内即被降解,无完整蛋白残留。热稳定性:ZmPSY1在42°C孵育15分钟丧失50%活性,50°C完全失活
  6. CRTI在51°C丧失50%活性,55°C完全失活。CRTI蛋白以100 mg/kg体重单次口服给予小鼠,未观察到不良反应或死亡。估算每日最大膳食暴露量:ZmPSY1约4.49 μg/kg体重,CRTI约0.85 μg/kg体重,PMI约29.96 μg/kg体重。生物信息学分析显示ZmPSY1与过敏原/毒素无显著相似性
  7. CRTI仅与蛇毒L-氨基酸氧化酶的FAD结合区域有同源性,且该同源性在天然水稻PDS中也存在,不构成毒性风险。

研究结论

GR2E水稻的分子特征和蛋白质安全性评估结果表明,其插入DNA稳定且无有害效应,新表达蛋白无致敏性和毒性风险,与常规水稻同样安全,支持其用于缓解维生素A缺乏症。

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