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CRISPR/Cas9 mediated mutagenesis of MORE AXILLARY GROWTH 1 in tomato confers resistance to root parasitic weed Phelipanche aegyptiaca

作者
Vinay Kumar Bari, Jackline Abu Nassar, Radi Aly
杂志
Scientific Reports(2021)
DOI
10.1038/s41598-021-82897-8
所属领域
代谢工程
关键词
CRISPR/Cas9MAX1Phelipanche aegyptiacaparasitic weed resistancestrigolactonestomato
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解决的核心问题

根寄生杂草Phelipanche aegyptiaca严重危害番茄等经济作物,缺乏有效防控方法;需要开发新的生物技术手段抑制寄生杂草种子萌发,减少作物产量损失。

研究策略

利用CRISPR/Cas9系统靶向编辑番茄独脚金内酯(SL)生物合成关键基因MAX1的第三外显子,降低SL(orobanchol)含量,从而抑制P. aegyptiaca种子萌发并赋予番茄抗性。

研究路线图

100%
研究问题:根寄生杂草严重危害番茄,缺乏有效防控方法
策略:CRISPR/Cas9靶向编辑MAX1第三外显子
关键改造:9 bp框内缺失,Lys-252/Arg-253/Iso-254缺失
结果1:编辑效率1/5,T1代35.7%无转基因且稳定遗传
结果2:SL含量降低,P. aegyptiaca块茎和芽显著减少
结果3:纯合突变体株高降低、腋芽增多、类胡萝卜素积累
结论:MAX1编辑抑制orobanchol合成,赋予番茄抗寄生杂草能力
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核心内容

该研究利用CRISPR/Cas9系统靶向编辑番茄独脚金内酯生物合成关键基因MAX1的第三外显子,以期抑制埃及列当(Phelipanche aegyptiaca)种子萌发并赋予番茄抗性。在T0代5个独立转基因系中,仅Line 1检测到编辑事件,突变类型为9 bp框内缺失,导致三个氨基酸缺失。T1代中35.7%植株为无转基因且突变稳定遗传,杂合与纯合突变体均表现出株高降低、腋芽增多等表型。与野生型相比,MAX1突变体上列当可存活块茎和芽数量显著减少,orobanchol含量显著降低,纯合突变体中PDS1表达上调,总类胡萝卜素、β-胡萝卜素和叶黄素含量增加。结果表明,通过CRISPR/Cas9编辑MAX1减少独脚金内酯合成可有效赋予番茄对根寄生杂草的抗性,为防控该类杂草提供了新策略。

创新点

首次在番茄中通过CRISPR/Cas9编辑MAX1基因获得对根寄生杂草P. aegyptiaca的抗性;编辑事件可稳定遗传且无脱靶效应;杂合突变体也表现出抗性表型。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
番茄(Solanum lycopersicum cultivar MP-1) 独脚金内酯(strigolactone)生物合成通路 MAX1 MAX1(细胞色素P450单加氧酶,CYP711A亚家族) 催化 催化carlactone氧化为carlactonic acid,进一步生成orobanchol;CRISPR/Cas9靶向第三外显子(Solyc08g062950),产生9 bp框内缺失。
番茄(Solanum lycopersicum cultivar MP-1) 独脚金内酯(strigolactone)生物合成通路 CCD8 类胡萝卜素裂解双加氧酶8 催化 参与carlactone合成;在MAX1突变体中转录水平无显著变化。
番茄(Solanum lycopersicum cultivar MP-1) 类胡萝卜素生物合成通路 PDS1 八氢番茄红素脱饱和酶1 催化 类胡萝卜素生物合成关键酶;在MAX1纯合突变体中表达显著上调,总类胡萝卜素含量增加。
番茄(Solanum lycopersicum cultivar MP-1) 独脚金内酯转运 ABCG45 ABC转运蛋白G45 转运 推测为SL转运蛋白(PDR1同源物);在MAX1突变体中表达无显著变化,不参与抗性机制。

关键发现

  1. 在T0代5个独立转基因系中,仅Line 1检测到MAX1靶位点编辑事件(1/5)
  2. 突变类型为9 bp框内缺失,导致Lys-252、Arg-253、Iso-254三个氨基酸缺失
  3. T1代中35.7%(5/14)植株为无转基因(transgene-free)且突变稳定遗传
  4. MAX1-Cas9杂合与纯合T1植株均表现出株高降低、腋芽增多、不定根形成等表型,纯合突变体变化更显著
  5. 与野生型相比,MAX1突变体上P. aegyptiaca可存活块茎和芽的数量显著减少,orobanchol含量显著降低
  6. 纯合突变体中PDS1基因表达显著上调,总类胡萝卜素、β-胡萝卜素和叶黄素含量增加,而CCD8、MAX1和ABCG45表达无显著变化。

研究结论

通过CRISPR/Cas9介导的MAX1基因编辑减少独脚金内酯(orobanchol)合成,可有效赋予番茄对根寄生杂草P. aegyptiaca的抗性,为防控根寄生杂草提供了新的策略。