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Deletion of the budBAC Operon in Klebsiella pneumoniae to Understand the Physiological Role of 2,3-butanediol Biosynthesis

作者
Daun Jeong, Jeongmo Yang, Soojin Lee, Borim Kim, Youngsoon Um, Youngrok Kim, Kyoung-Su Ha, Jinwon Lee
单位
韩国首尔西江大学化学与生物分子工程系; 韩国首尔韩国科学技术研究院清洁能源中心; 韩国龙仁庆熙大学生命科学与资源研究所及食品科学与生物技术系
杂志
Preparative Biochemistry and Biotechnology(2015)
DOI
10.1080/10826068.2015.1045603
所属领域
代谢工程
关键词
2,3-丁二醇CO2排放budBAC操纵子氧化还原平衡碳分布分析
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解决的核心问题

肺炎克雷伯氏菌产生2,3-丁二醇的生理角色尚不清楚;通过敲除budBAC操纵子,研究2,3-丁二醇合成在混合酸发酵中的生理作用,尤其是对碳分布、CO2排放和氧化还原平衡的影响。

研究策略

构建budBAC操纵子缺失菌株SGSB109(在致病性减弱的SGSB100 ΔwabG基础上),通过比较两菌株在批量发酵中的细胞外代谢物、CO2排放、碳分布和NADH/NAD+平衡,系统分析2,3-丁二醇生物合成的生理功能。

研究路线图

100%
研究问题:Kp中2,3-丁二醇合成的生理角色不明
策略:敲除budBAC,构建ΔwabG背景缺失株SGSB109
关键改造:删除budB/budA/budC三个基因(位于budBAC操纵子)
结果1:代谢产物重构(乳酸11.3 g/L↑2.3倍,乙酸2.51 g/L↑4.1倍)
结果2:CO2排放峰值从1.15%降至0.39%,碳摄取减少30.6%
结果3:碳分布解析(α-乙酰乳酸60.4%→乳酸51.0%,CO2碳分配37.8%→10.7%)
结论1:2,3-丁二醇合成可防止培养基酸中毒(中性无毒产物)
结论2:2,3-丁二醇合成是消耗过量NADH、维持氧化还原平衡的主要途径
结论3:2,3-丁二醇通过释放CO2促进碳底物摄取(生理碳汇)
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核心内容

本研究以致病性减弱的肺炎克雷伯氏菌SGSB100(ΔwabG)为背景,通过敲除budBAC操纵子构建缺失菌株SGSB109,从生理学角度系统考察2,3-丁二醇合成的功能。比较两菌株批量发酵中的代谢物分布、CO2排放、碳流分配及NADH/NAD+平衡后发现,敲除后2,3-丁二醇完全消失,乳酸产量升至11.3 g/L(为野生型的2.3倍),乙酸产量达2.51 g/L(提高4.1倍),CO2排放峰值从1.15%降至0.39%,碳底物摄取减少30.6%。碳分布分析显示,SGSB100将60.4%碳流向α-乙酰乳酸,而SGSB109将51.0%碳导向乳酸,CO2碳分配下降71.7%,乙酸碳分配则增加42.1倍,同时生物质、戊糖磷酸途径和TCA循环的碳分配均有上升。结果表明,2,3-丁二醇作为中性无毒产物,其合成既能通过消耗过量NADH维持氧化还原平衡、防止培养基酸化,又通过释放CO2促进碳底物摄取,是混合酸发酵中关键的代谢调节枢纽。

创新点

首次从生理学角度而非工业应用角度研究2,3-丁二醇生物合成的角色;利用碳分布分析揭示2,3-丁二醇合成作为CO2释放和碳底物摄取的主要途径;阐明了2,3-丁二醇在防止培养基酸化和维持氧化还原平衡中的关键作用。

研究对象(5)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Klebsiella pneumoniae SGSB100 (ΔwabG) 2,3-丁二醇生物合成通路 (budBAC operon) budB α-乙酰乳酸合酶 (α-acetolactate synthase) 催化 催化两分子丙酮酸缩合生成α-乙酰乳酸,2,3-丁二醇合成第一步
Klebsiella pneumoniae SGSB100 (ΔwabG) 2,3-丁二醇生物合成通路 (budBAC operon) budA α-乙酰乳酸脱羧酶 (α-acetolactate decarboxylase) 催化 催化α-乙酰乳酸脱羧生成乙偶姻
Klebsiella pneumoniae SGSB100 (ΔwabG) 2,3-丁二醇生物合成通路 (budBAC operon) budC 乙酰偶姻还原酶/丁二醇脱氢酶 (acetoin reductase) 催化 催化乙偶姻还原为2,3-丁二醇,同时消耗NADH
Klebsiella pneumoniae KCTC2242 2,3-丁二醇生物合成调控 budR LysR型转录调控因子 (LysR-type transcriptional regulator) 调控 调控budBAC操纵子表达,受乙酸诱导
Klebsiella pneumoniae KCTC2242 脂多糖生物合成 wabG 葡萄糖基转移酶 (glucosyltransferase) 催化 缺失该基因可降低致病性,用于构建SGSB100

关键发现

  1. SGSB109敲除budBAC后,2,3-丁二醇不再产生,乳酸产量达11.3 g/L(为SGSB100的2.3倍),乙酸产量2.51 g/L(提高4.1倍)
  2. CO2排放峰值从SGSB100的1.15%降至SGSB109的0.39%
  3. 碳底物摄取减少30.6%(737 vs 511 mmol)
  4. 碳分布中,SGSB100将60.4%碳流向α-乙酰乳酸,而SGSB109将51.0%碳流向乳酸
  5. CO2碳分配从37.8%降至10.7%(降低71.7%)
  6. SGSB109中乙酸碳分配增加42.1倍
  7. 生物质形成碳分配从3.86%升至5.24%,戊糖磷酸途径从5.19%升至6.85%,TCA循环从9.59%升至11.5%。

研究结论

2,3-丁二醇是中性无毒代谢产物,其合成可防止培养基酸中毒;2,3-丁二醇合成是消耗过量NADH、维持细胞氧化还原平衡的主要途径;同时通过释放CO2作为废物促进碳底物摄取。