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Induction of Terpene Biosynthesis in Berries of Microvine Transformed with VvDXS1 Alleles

作者
Lorenza Dalla Costa, Francesco Emanuelli, Massimiliano Trenti, Paula Moreno-Sanz, Silvia Lorenzi, Emanuela Coller, Sergio Moser, Davide Slaghenaufi, Alessandro Cestaro, Roberto Larcher, Ivana Gribaudo, Laura Costantini, Mickael Malnoy, M. Stella Grando
单位
Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, Genomics and Biology of Fruit Crop Department, San Michele all'Adige, Italy; Center Agriculture Food Environment, University of Trento, San Michele all'Adige, Italy; Research and Innovation Centre, Fondazione Edmund Mach, Computational Biology Platform, San Michele all'Adige, Italy; Technology Transfer Centre, Fondazione Edmund Mach, Experiment and Technological Services Department, San Michele all'Adige, Italy; Institute for Sustainable Plant Protection - CNR, Grugliasco, Italy
杂志
Frontiers in Plant Science(2018)
DOI
10.3389/fpls.2017.02244
所属领域
植物代谢工程
关键词
TaqMan cardVitis viniferaVvDXS1 allelesfunctional SNPgain-of-function mutationmicrovinemonoterpenesesquiterpene
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解决的核心问题

探究葡萄VvDXS1基因及其K284N突变对单萜和倍半萜生物合成的调控作用,并利用代谢工程手段在microvine模型中提高葡萄香气相关萜类化合物的积累。

研究策略

将VvDXS1的野生型(中性)等位基因和突变型(麝香型,K284N)等位基因分别转入microvine葡萄模型,通过TaqMan阵列定量分析萜类合成相关基因的表达谱,并结合GC-MS定量检测成熟果实中游离态和结合态单萜及倍半萜含量,系统评估MEP途径通量增强对下游萜类代谢的影响。

研究路线图

100%
研究问题:VvDXS1及其K284N突变对葡萄萜类合成的影响
策略:构建野生型与K284N突变型转化microvine模型
注:Mi-M1=K284N突变型,Mi-N4=野生型过表达,Mi-WT=野生型对照
Aromix芯片覆盖:MEP/MVA途径、类胡萝卜素、单萜、倍半萜等83个靶标基因
SNP1822 T等位基因:62/70品种总单萜>4mg/kg;G/G纯合型均<1mg/kg
关键改造①:TaqMan阵列(Aromix)分析83个萜类基因表达谱
关键改造②:GC-MS定量游离态和结合态单萜与倍半萜含量
关键发现:K284N突变提高催化效率而非表达量
结果:Mi-M1单萜总量提高4.4倍倍半萜同步上调
结论:VvDXS1是萜类代谢工程有效靶点K284N优于过表达
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核心内容

该研究以微葡萄为模型,分别转入葡萄VvDXS1基因的野生型中性等位基因和麝香型K284N突变等位基因,通过TaqMan阵列定量分析83个萜类代谢相关基因的表达,并结合GC-MS检测成熟果实中单萜和倍半萜含量,探究该基因对萜类生物合成的调控作用。结果显示,K284N突变型转化株(Mi-M1)总结合态单萜达2500 μg/kg,为野生型529 μg/kg的4.4倍,而仅过表达野生型基因的Mi-N4为991 μg/kg,野生型的1.7倍;Mi-M1中游离态单萜约500 μg/kg,也显著高于其他株系。值得注意的是,Mi-M1中VvDXS1总表达量仅为Mi-N4的六分之一,但单萜积累更高,表明K284N突变通过提升酶催化效率而非增加转录水平来促进代谢流。此外,转化植株中MEP和MVA途径多个基因以及类胡萝卜素、倍半萜合成基因在花期和转色期显著上调。该工作表明VvDXS1是增强葡萄单萜通量的有效靶点,功能获得性突变比过表达更具优势,且对倍半萜途径也有潜在调控作用。

创新点

['首次在葡萄microvine模型系统中表达不同VvDXS1等位基因并进行功能验证', '开发了基于TaqMan阵列(Aromix)的葡萄萜类代谢基因高通量表达分析工具,覆盖83个靶标基因', '发现VvDXS1基因型对单萜积累具有高预测价值,并首次报道其对倍半萜含量也有影响', '证明K284N突变通过提高酶催化效率比单纯增强VvDXS1表达更能有效促进单萜生物合成']

研究对象(10)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) MEP途径(甲基赤藓醇磷酸途径) VvDXS1(等位基因K284N和K284) 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶(DXS) 催化 MEP途径第一个限速酶,K284N突变提高催化效率;也用于葡萄种质资源基因型分析
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) MEP途径 HDR(VIT_03s0063g02030) 羟甲基丁烯基二磷酸还原酶 催化 MEP途径末端酶,在转化植株花期显著上调
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) MVA途径(甲羟戊酸途径) AACT(VIT_12s0057g01200) 乙酰辅酶A酰基转移酶 催化 在转化植株中强烈上调,表明MEP与MVA途径存在协同调节
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) MVA途径 HMGS(VIT_02s0025g04580) 羟甲基戊二酰辅酶A合酶 催化 MVA途径关键酶,在Mi-N4中显著上调
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) MVA途径 HMGR3(VIT_03s0038g04100) 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶 催化 MVA途径的重要调控酶,在转化植株中表达上调
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) 类胡萝卜素生物合成途径 PSY(VIT_04s0079g00680) 八氢番茄红素合酶 催化 类胡萝卜素途径限速酶,观察到只表达一种剪接变体
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) 类胡萝卜素/脱辅基类胡萝卜素途径 CCD4(VIT_02s0087g00910) 类胡萝卜素裂解双加氧酶4 催化 参与降异戊二烯类香气物质生成,在Mi-N4中显著高于WT
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) 单萜生物合成途径 OciS(VIT_12s0134g00020) 罗勒烯合酶 催化 花器官特异表达的萜烯合酶,在转化植株花期显著上调
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) 倍半萜生物合成途径 ValS(VIT_18s0001g04050) 瓦伦烯合酶 催化 催化生成瓦伦烯,在转化植株花期显著上调
微葡萄(Vitis vinifera cv. microvine 04C023V0006) 倍半萜生物合成途径 Germacrene D synthase(VIT_18s0001g04280) 大牻牛儿烯D合酶 催化 成熟期在Mi-M1中强烈表达

关键发现

  1. 在70个含SNP1822 T等位基因的葡萄品种中,62个总单萜含量高于4 mg/kg,而17个G/G纯合基因型品种均低于1 mg/kg。成熟microvine果实中,Mi-M1(K284N突变型)总结合态单萜为2500 μg/kg,Mi-N4(过表达野生型)为991 μg/kg,Mi-WT为529 μg/kg
  2. 游离态单萜在Mi-M1中约500 μg/kg,远高于Mi-N4和Mi-WT。Mi-M1和Mi-N4的总单萜含量分别较野生型提高4.4倍和1.7倍,其中游离态和结合态单萜的倍数变化分别为3.2-4.7和1.3-1.9。Mi-M1中VvDXS1总表达量仅为Mi-N4的六分之一,但单萜积累量更高,表明K284N突变增强催化效率是关键因素。此外,转化植株中MEP和MVA途径多个基因(如HDR、AACT、HMGS、HMGR3)在花期和转色期显著上调,类胡萝卜素、单萜和倍半萜合成基因也受到不同程度诱导。

研究结论

VvDXS1是提高葡萄单萜生物合成通量的有效靶点,其K284N功能获得性突变比单纯过表达野生型基因更能显著促进单萜积累,且该基因对倍半萜途径也有潜在调控作用。转基因microvine的萜类代谢途径在转录水平和代谢水平均发生显著扰动,但植物形态和物候未受明显影响。