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The Promoter for Tomato 3-Hydroxy-3-Methylglutaryl Coenzyme A Reductase Gene 2 Has Unusual Regulatory Elements That Direct High-Level Expression

作者
Nikolai Dmitri Daraselia, Svetlana Tarchevskaya, Jonathon Orin Narita
单位
University of Illinois at Chicago, Laboratory for Molecular Biology
杂志
Plant Physiology(1996)
DOI
10.1104/pp.112.2.727
所属领域
代谢工程
关键词
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶5'非翻译区HMG2启动子基因表达调控番茄翻译调控
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解决的核心问题

解析番茄HMG2基因启动子中控制高水平表达的调控元件及其作用机制

研究策略

采用粒子轰击瞬时表达系统,构建HMG2启动子与萤火虫荧光素酶(Luc)融合的翻译和转录报告载体,通过5'缺失、替换突变和体外翻译实验,定位高水平表达所需的启动子区域。

研究路线图

100%
研究问题:解析HMG2启动子高水平表达调控元件
策略:粒子轰击瞬时表达系统构建报告载体
关键改造:5'缺失+替换突变+Lnc融合载体
结果1:HMG2果实成熟期高表达与番茄红素同步
结果2:-58至+129区活性与35S相当
结果3:5'UTR缺失降至7%,替换13%
结果4:起始区融合使表达提高3倍(体内)/10倍(体外)
结果5:ATG区可形成双发夹结构(-9.1/-9.5 kcal/mol)
结论:新型强启动子依赖下游正调控元件双重调控
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核心内容

该研究解析了番茄HMG2基因启动子中控制高水平表达的新型调控元件。通过粒子轰击瞬时表达系统,将HMG2启动子与萤火虫荧光素酶基因融合,结合5′缺失、替换突变及体外翻译实验,定位了驱动强表达的关键区域。结果显示,含-58至+129区域(涵盖TATA、5′非翻译区和翻译起始区)的HMG2-Luc翻译融合活性与35S启动子相当;删除5′UTR后表达降至7%,替换为无关序列后为13%。进一步发现,HMG2翻译起始区融合到Luc基因可在35S启动子驱动下将表达提高约3倍,在小麦胚芽体外翻译系统中使mRNA翻译效率提高10倍,该区域ATG周围序列可形成自由能分别为-9.1和-9.5 kcal/mol的两个发夹结构。成熟番茄果实中HMG2 mRNA与番茄红素合成同步高水平积累。该启动子的强表达不依赖TATA上游序列,而由TATA下游的正调控元件通过转录与翻译双重机制协同驱动,代表了一类新型强植物启动子。

创新点

发现HMG2启动子的高水平表达不依赖TATA上游序列,而是由TATA下游的5'非翻译区(富含嘧啶的CT序列)和翻译起始区(可形成替代发夹结构)中的正调控元件控制;首次报道植物HMGR基因启动子的这种新颖调控方式。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
番茄果实(Lycopersicon esculentum cv VFNT) 甲羟戊酸/异戊二烯生物合成 HMG2 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR) 催化 HMG2在成熟果实中高表达,其启动子为本研究分析对象
番茄果实(Lycopersicon esculentum cv VFNT) 甲羟戊酸/异戊二烯生物合成 HMG1 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR) 催化 HMG1在幼果中高表达,与HMG2差异表达
番茄果实(Lycopersicon esculentum cv VFNT) 甲羟戊酸/异戊二烯生物合成 HMG3 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR) 催化 HMG3表达水平较低,启动子序列与HMG1/2有差异
无(体外翻译系统:小麦胚芽/兔网织红细胞) 报告基因 Luc(firefly luciferase) 萤火虫荧光素酶 催化 作为报告基因用于评估启动子和翻译起始区活性

关键发现

  1. HMG2 mRNA在成熟番茄果实中高水平积累,与番茄红素合成同步
  2. HMG1 mRNA仅在幼果中高表达。在粒子轰击瞬时表达系统中,含-58至+129区域(含TATA、5'UTR和翻译起始区)的HMG2-Luc翻译融合活性与35S启动子相当
  3. 删除5'UTR后表达降至7%,替换为无关序列后为13%。将HMG2翻译起始区融合到Luc基因,在35S启动子驱动下表达提高约3倍
  4. 在小麦胚芽体外翻译系统中,含HMG2起始区的mRNA翻译效率提高10倍,但兔网织红细胞裂解物中无差异。ATG周围序列可能形成两个发夹结构,自由能分别为-9.1和-9.5 kcal/mol。转录融合比翻译融合活性低3-4倍
  5. 无TATA的构建体活性低于1%。

研究结论

番茄HMG2启动子代表一类新型强植物启动子,其高水平表达依赖于TATA下游的5'UTR和翻译起始区中的正调控元件,这些元件通过转录和翻译双重机制增强表达。