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Mutational and Functional Analysis of the β-Carotene Ketolase Involved in the Production of Canthaxanthin and Astaxanthin

作者
Rick W. Ye, Kristen J. Stead, Henry Yao, Hongxian He
单位
DuPont Central Research and Development, Wilmington, Delaware
杂志
Applied and Environmental Microbiology(2006)
DOI
10.1128/AEM.00918-06
所属领域
代谢工程
关键词
CrtWβ-胡萝卜素酮醇酶丙氨酸扫描突变定向进化虾青素角黄素
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解决的核心问题

解析β-胡萝卜素酮醇酶(CrtW)中保守氨基酸残基的功能作用,并提高CrtW在虾青素生物合成中的催化效率与选择性。

研究策略

采用丙氨酸扫描突变系统分析CrtW保守残基的功能,利用颜色筛选系统结合易错PCR随机突变,筛选具有更高虾青素选择性的CrtW突变体。

研究路线图

100%
研究问题:解析CrtW保守残基功能,提高虾青素催化选择性
策略:丙氨酸扫描突变分析 + 易错PCR随机突变筛选
关键改造①:开发菌落颜色高通量筛选系统
关键改造②:丙氨酸扫描鉴定必需组氨酸残基(H65/H103/H106/H107/H221/H222)
关键改造③:随机突变获得L175M、M99V、M99I高选择性突变体
关键改造④:D117A突变导致单酮基中间体echinone积累
结果:野生型产72%虾青素,L175M提高至78%,D117A积累62%中间体
结论:CrtW为铁依赖整合膜蛋白,L175M等突变可用于虾青素代谢工程改造
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核心内容

该研究以大肠杆菌为宿主,系统解析了β-胡萝卜素酮醇酶(CrtW)保守氨基酸残基的功能,并借助基于菌落颜色的高通量筛选系统,通过易错PCR随机突变筛选出提高虾青素选择性的CrtW突变体。丙氨酸扫描发现H65、H103、H106、H107、H221和H222为催化必需残基,D117A突变在含β-胡萝卜素基因簇的宿主中导致echinone大量积累至62.1%,而野生型仅为2.5%,说明D117对底物特异性具有关键影响。随机突变获得的L175M突变体在含玉米黄质合成基因簇的菌株中使虾青素比例从野生型的53%提升至78%,adonixanthin从33%降至5%;M99V和M99I同样显著提高虾青素产量。含玉米黄质与β-胡萝卜素基因簇的菌株总类胡萝卜素滴度分别达0.6 mg/g和0.9 mg/g干细胞重。该研究不仅阐明了CrtW的催化机制与底物选择性决定位点,还提供了可直接用于代谢工程改造的有效突变位点,为虾青素的高效微生物合成奠定了基础。

创新点

开发了基于菌落颜色的高通量筛选系统,用于识别提高虾青素选择性的CrtW突变体;首次报道L175M、M99V和M99I三个突变能显著提高虾青素产量;发现部分失活突变导致单酮基中间体积累,如D117A导致echinone大量积累。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli Top 10 类胡萝卜素生物合成(虾青素/角黄素) crtW β-胡萝卜素酮醇酶(CrtW) 催化 来自Paracoccus sp. N81106,丙氨酸扫描和随机突变的研究对象
Escherichia coli Top 10 类胡萝卜素生物合成(玉米黄质) crtZ β-胡萝卜素羟化酶(CrtZ) 催化 与crtW共表达,用于合成含羟基的类胡萝卜素中间体
Escherichia coli Top 10 β-胡萝卜素生物合成 crtE, idi, crtY, crtI, crtB GGPP合酶、异戊烯基焦磷酸异构酶、番茄红素β-环化酶、八氢番茄红素脱氢酶、八氢番茄红素合酶 催化 基因簇crtE-idi-crtYIB,用于合成β-胡萝卜素前体
Escherichia coli MG1655 P_TS-dxs 类胡萝卜素生物合成(虾青素) crtW CrtW酮醇酶(突变体L175M、M99V、M99I) 催化 高碳通量菌株中评估突变体对虾青素产量的改善效果

关键发现

  1. 野生型CrtW在含玉米黄质合成基因簇的E. coli中产生72.0%虾青素、16.1%adonixanthin、1.6%玉米黄质
  2. 在含β-胡萝卜素合成基因簇的宿主中产生91.3%角黄素。丙氨酸扫描显示H65、H103、H106、H107、H221、H222为酶活性必需,H69和H218部分必需。D117A突变在β-胡萝卜素宿主中积累62.1%的echinone,而野生型仅2.5%。随机突变体L175M在高通量菌株中使虾青素比例从野生型的53%提高到78%,adonixanthin从33%降至5%。含玉米黄质基因簇和β-胡萝卜素基因簇的菌株总类胡萝卜素滴度分别为0.6 mg/g和0.9 mg/g干细胞重。

研究结论

CrtW属于铁依赖的整合膜蛋白家族,三个组氨酸基序是催化所必需的,但并非所有保守组氨酸都同样重要。D117等残基对底物特异性有重要影响。通过颜色筛选系统获得的L175M、M99V和M99I突变体提高了虾青素选择性,可用于代谢工程改造虾青素生物合成途径。